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許國旺團隊連續(xù)發(fā)文:高覆蓋脂質(zhì)組學(xué)分析新進展

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  脂質(zhì)組學(xué)在生命科學(xué)研究中占據(jù)非常重要的地位。但是,全面的脂質(zhì)分析受到脂質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性、性質(zhì)復(fù)雜性的挑戰(zhàn)。常用的基于質(zhì)譜技術(shù)的脂質(zhì)組學(xué)分析方法包括直接進樣(“鳥槍法”)、色譜-質(zhì)譜聯(lián)用、基質(zhì)輔助激光解離質(zhì)譜成像等,而超高效液相色譜-高分辨質(zhì)譜(UHPLC-HRMS)非靶向分析和UHPLC -三重四極桿質(zhì)譜靶向分析是最常用的分析平臺之一,存在著各自鮮明的優(yōu)缺點。

  近日,中科院大連化物所的許國旺研究員團隊在基于UHPLC-HRMS聯(lián)用技術(shù)分析脂質(zhì)代謝物方面取得了新進展,研究結(jié)果發(fā)表在 Analytical Chemistry 雜志 (2018 Jun 8. doi: 10.1021/acs.analchem.8b01331.)。

  該課題組結(jié)合非靶向和靶向方法的優(yōu)勢,建立了一種具有高檢測覆蓋度的擬靶向脂質(zhì)組學(xué)分析方法,涵蓋19個脂類,3377個脂質(zhì)離子對,覆蓋7000多種脂質(zhì)分子結(jié)構(gòu)。

  該課題組首先使用UHPLC-HRMS聯(lián)用技術(shù)在全掃(Full Scan)和數(shù)據(jù)依賴采集(DDA)模式下對不同來源的生物樣品(細胞、組織、血漿)進行分析,根據(jù)獲得的保留時間、精確分子量以及二級碎片信息對脂質(zhì)分子進行歸屬。沒有二級碎片的脂質(zhì)分子通過與已知脂質(zhì)或自建數(shù)據(jù)庫中的保留時間和精確分子量進行比對,靶向提取脂質(zhì)信息,以獲得盡可能大的脂質(zhì)覆蓋度。

  對于理論存在但是未被檢測到的脂質(zhì)分子(文中稱擴展脂質(zhì)),通過保留時間與已知脂質(zhì)的?;湹奶紨?shù)或?;湹碾p鍵數(shù)之間的關(guān)系對保留時間進行預(yù)測。根據(jù)脂質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)特征以及質(zhì)譜行為,建立包含已知脂質(zhì)和擴展脂質(zhì)的離子對數(shù)據(jù)庫。

  最后,將所有的脂質(zhì)離子對應(yīng)用到動態(tài)多反應(yīng)監(jiān)測中,建立基于液相色譜-質(zhì)譜的高覆蓋擬靶向脂質(zhì)組學(xué)分析方法。該方法具有良好的線性、重復(fù)性,更低的檢測線,更高的覆蓋度,更好的數(shù)據(jù)質(zhì)量,尤其適合大規(guī)模脂質(zhì)組學(xué)分析。

  該研究得到了國家自然科學(xué)基金項目、國家重點研究發(fā)展計劃以及大連化物所創(chuàng)新基金的資助。

  該論文作者:

  Qiuhui Xuan, Chunxiu Hu, Di Yu, Lichao Wang, Yang Zhou, Xinjie Zhao, Qi Li, Xiaoli Hou, and Guowang Xu.

  鏈接:

  http://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b01331

  標題:

  Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics

  Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography?

  Mass Spectrometry

  出處:

  Anal. Chem., May 29, 2018, DOI: 10.1021/acs.analchem.8b01331


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